Župnijska cerkev svete Cecilije in kapucinski samostan v Celju imata bogato štiristoletno zgodovino. Zgrajena sta bila na željo vernikov in z njihovo pomočjo. Temeljni kamen je bil položen 25. oktobra 1609, cerkev pa je 14. novembra 1615 posvetil ljubljanski škof Tomaž Hren in jo izročil v varstvo sveti Ceciliji.

Kapucinski samostan je skozi stoletja doživljal različne spremembe. Leta 1910 je bil povečan, leto pozneje pa so cerkvi dozidali kapele. Leta 1935 je bila zgrajena še nova stavba, namenjena notranjemu konviktu. Med drugo svetovno vojno so leta 1941 nemške oblasti kapucine izgnale, samostan pa uporabljale kot zapor. Po vojni so se bratje za nekaj časa naselili v konviktu, vendar so bili leta 1947 ponovno izgnani. Leto pozneje sta bila samostan in vrt nacionalizirana. Kapucini so se v Celje vrnili leta 1958 in si uredili bivanje v zakristijskih prostorih.

Pomemben mejnik v zgodovini kraja je bila ustanovitev župnije svete Cecilije 4. septembra 1960. Leta 1986 je bila župniji vrnjena stavba nekdanjega notranjega konvikta, kjer so bili urejeni novi stanovanjski prostori za kapucine. Ob koncu leta 1994 je bil samostan v postopku denacionalizacije vrnjen v last kapucinskega reda. Leta 2005 se je začela temeljita obnova samostana, ki je ponovno zaživel kot dom molitve, bratstva in služenja ljudem.

Celjski kapucinski samostan je najstarejši kapucinski samostan na Slovenskem. Ob 400-letnici položitve temeljnega kamna leta 2009 smo se z hvaležnostjo spominjali bogate dediščine, ki so jo skozi stoletja ustvarjali verniki, kapucini in vsi, ki so bili povezani s tem svetim krajem.

Poleg župnijske cerkve svete Cecilije sodita v župnijo tudi dve podružnični cerkvi. Cerkev svetega Luka v Tremerju se prvič omenja leta 1823 kot kapela z zvonikom, leta 2006 pa je bila posvečena kot cerkev. Cerkev svetega Miklavža na Miklavškem hribu sega v čas Celjskih grofov. Zgrajena naj bi bila ob koncu 14. oziroma v začetku 15. stoletja in je posebej znana po svojih treh zlatih oltarjih.

Danes je cerkev svete Cecilije skupaj s kapucinskim samostanom prostor molitve, bogoslužja, srečevanja in odprtosti za vse, ki iščejo Boga, mir in bližino skupnosti.